Sommario
Diecimila anni fa, un grande e potente Digimon fu sconfitto e sigillato dai Sacri Cavalieri come il "Digi Core". Anni dopo, un virus ha infettato il mondo digitale, lasciando solo quelli che possedevano l'anticorpo D (X-Antibody). Gli unici membri degli Holy Knights rimasti sono Omega of Power (Omnimon X), Duke of Courage (Medieval Gallantmon / Gallantmon X) e Magna of Miracles (Magnamon).
All'inizio della serie, il "Dio della morte" MetalPhantomon attira Hikaru, Kiyoshi, Masuken e Teru nel mondo digitale. Originariamente, Hikaru viene lasciata sola con il suo Digimon (che inizia come Dorimon) e deve combattere i suoi amici Teru e Masuken, che sono sotto il controllo di MetalPhantomon.
Ad un certo punto, MetalPhantomon ruba lo "Spirito del drago" del partner di Masaru, che ora è un Dorumon. Mentre MetalPhantomon lo usa per far rivivere il Digi-Core, Hikaru, Teru e Masuken imparano da Omega of Power che possono ottenere un nuovo Dragon Spirit da Duke of Courage - con questo, possono salvare la vita di Dorumon. Ma quando arrivano nell'area del Digital World di Duke, ricevono una serie di test dal servitore di Duke, MameTyramon.
Dopo aver completato i test e aver combattuto Duke stesso, riescono a guadagnare Dorumon un nuovo Spirito Drago. Tuttavia, ora devono combattere MetalPhantomon, che ha resuscitato Digi-Core come Dexmon. Alla fine, Hikaru e gli altri riescono a salvare il loro amico Kiyoshi, sigillato all'interno di Dexmon, e tornare nel mondo reale.