Un'enorme anomalia ha devastato la terraferma in Giappone e ha rovinato gran parte di Tokyo, affondando tre quarti della città nell'oceano.
Dieci anni dopo, la narrazione si sposta su Ganta Igarashi, un allievo apparentemente medio che frequenta la scuola media della Prefettura di Nagano. In quanto evasa, sopravvissuta al terremoto che è fantastico, Ganta ha vissuto una vita regolare e non ha ricordi del disastro. Tutto cambia quando uno strano uomo coperto di armature di rubini e sangue fluttua attraverso le finestre della sua classe. Sorridendo follemente, l '"Uomo Rosso" massacra l'intera classe di Ganta ma, piuttosto di ucciderlo, incorpora un frammento di cristallo rossastro nel torso di Ganta. A pochi giorni dal massacro, Ganta viene condannato a morte a Deadman Wonderland, una prigione che funge anche da parco a tema ed è sottoposta a qualche aula di tribunale canguro come imputato.
Arrivato in prigione, Ganta è dotato di un'apprensione unica che traccia gli indicatori importanti e il suo posto. Una tossina mortale viene continuamente iniettata nel suo flusso sanguigno attraverso la presa, ma tuttavia, può essere neutralizzata da un particolare trattamento simile a un dolce ogni tre volte, che spesso viene svolto attraverso varie azioni in prigione, cioè esibendosi per la folla , operare nel back-stage, acquistare con fattori falsi (un tipo di denaro tra i prigionieri del Deadman Wonderland), ecc. Per riunire i Cast Point, un colpevole deve eseguire i giochi mortali della struttura e vivere. Fortunatamente per Ganta, una misteriosa donna di nome Shiro, che a quanto pare capisce Ganta, viene aiutata da altri prigionieri allo stesso tempo.
Pur desiderando vivere come un criminale nel braccio della morte, Ganta intende individuare l '"uomo rosso" per cancellare il suo titolo. In una strana svolta, Ganta inizia ad acquisire la capacità di controllare il suo sangue, di renderlo un'arma per l'idea. Sconosciuto a Ganta, è diventato uno dei "Deadmen" della prigione, un numero isolato di prigionieri ha i rami del peccato che li rende capaci di controllare il proprio sangue. Ganta è costretto a prendere parte a crudeli scontri mortali tra gladiatori chiamati Carnival Corpse, i cui spettatori anonimi pagano ingenti somme di denaro per osservare dopo che la sua abilità è stata trovata. Nella sua lunga battaglia per vivere riesce a fare amicizia con alcuni di quelli che ha combattuto nello stadio e con il loro aiuto, Ganta procede la sua ricerca per scoprire l'identificazione dell '' 'uomo rosso' ', perché si è trasformato in un uomo morto, così come gli oscuri segreti che le autorità penitenziarie nascondono
