Da Wikipedia: Ambientata nell'era moderna, la storia parla di Miharu Rokujou, che voleva solo vivere una vita normale ed ereditare un ristorante Okonomiyaki. Al momento, il suo problema più grande erano le continue insistenze da parte di Kouichi Aizawa e Durandal Thobari Kumohira, che avevano fondato un club Nindō (忍道?, lett. "La Via dei Ninja"). Miharu non voleva avere niente a che fare con i "ninja" e rifiutava ogni volta. Ma presto viene attaccato da un vero gruppo di ninja e viene protetto da Kouichi e Kumohira. Lì, Miharu apprende del mondo ninja nascosto Nabari, dei ruoli del suo compagno di classe e insegnante in quel mondo e dell'arte segreta Shinra Banshou (森羅万象 Shinrabanshō?, lett. "Tutte le cose in natura") dentro di lui. L'arte segreta, che contiene tutta la conoscenza del mondo, è estremamente ambita a Nabari. E per questo motivo, Miharu non può tornare alla sua vita normale. Deve diventare il "Sovrano di Nabari" per sopravvivere. Da Baka-Updates: Rokujou Miharu era uno studente delle medie apparentemente riluttante che viveva nel suo mondo. Tuttavia, dentro di lui si nasconde il potere supremo di Nabari, “Onnipotente”. Per possedere un'arma così suprema, il branco di lupi di Iga giurò di riportare Miharu al villaggio di Iga. D'altra parte, l'insegnante di inglese di Miharu, Kumohira sensei, e il compagno di classe, Kouichi, erano i ninja Banten la cui missione era proteggere Miharu. Iniziò così una guerra per la proprietà di “Onnipotente”. Per sopravvivere, Miharu deve entrare nel mondo nascosto Nabari, per diventare il re.
